脉动真空蒸汽灭菌器主要利用饱和蒸汽为灭菌介质，通过脉动真空的方式使饱和蒸汽完全穿透到物品表面，利用高压下的高温饱和蒸汽杀灭所有微生物及其芽胞，灭菌效果可靠，是物理灭菌法中常用的方法。
脉动真空蒸汽灭菌器的应用范围广泛，适用于对口腔科、眼科、手术室、供应室等医疗卫生部门中所有包装的或无包装的实心器械、A类空腔器械（如牙科手机、内窥镜）、植入性器械、敷料织物、橡胶导管等进行灭菌。
